肛瘘自然愈合的几乎很少，手术是主要疗法，常能获得痊愈，但有一定的复发率。不适合手术的病例，可用非手术疗法，一般能减轻症状，防止瘘管向纵深蔓延，控制其发展。

　　目前，由冯绍安医师研制的中医外治疗法，即“祛腐拔毒，纯中药外敷渗透疗法”在治疗顽固性痔疮、复杂性肛瘘等肛肠疾病方面取得了一定的进展。该疗法全程采用纯中药散剂、膏剂外敷病灶，祛腐拔毒、生肌长皮，可彻底祛除皮下病灶及坏死组织，避免了手术操作，无并发症及后遗症，患者痛苦较小，且不影响正常生活、工作，具有一定的医疗特色和推广价值。