尿道下裂的治疗前提首先是确定患者的性别，特别是对阴囊会阴型尿道下裂，若伴有睾丸未下降，两侧阴囊严重发育不良，状如阴唇者，应与性别畸形相区别，待确定性别后再制订治疗方案。

　　选择在6-18月龄进行手术较妥，有些医师主张在6-9月龄时手术。尿道下裂的传统术式分为两期进行。第一期手术进行阴茎腹侧纤维束切除及阴茎弯曲矫正；第二期手术进行尿道再造，两期手术间隔应在6个月以上。在婴儿时期手术宜采用全身麻醉；6-7岁以后或成年施行手术者，可采用全身麻醉或硬膜外麻醉。

　　一般尿道下裂修复术，多半采用带血管的皮瓣再造尿道，同时矫正阴茎弯曲，成功极高，目前应用较为广泛。