阴茎的皮肤薄而且可以移动。阴茎皮肤在阴茎头处褶成双层，称为包皮，在7岁之前，包皮较长，能完全包住阴茎头及尿道外口。随着青春期发育，阴茎体积增大并加长，包皮向后退缩，至成人后阴茎头露出。但是，约30％的成人包皮仍完全遮盖阴茎头。只有用手将包皮上翻或当阴茎充分勃起，阴茎头和尿道口才能露出时，称为包皮过长。当包皮口过小，过紧，不能上翻或勃起时仍不能露出龟头和尿道口时，称为包茎，约占8％。由于包皮过长或包茎，使包皮皮脂腺分泌的一种奇臭的白色分泌物不能排出去，长期积存就会成为包皮垢。如果不注意清洗，包皮垢积存过多会刺激阴茎头和包皮发炎，甚至粘连。除可引起性交痛，最后妨碍夫妻性生活外，还会导致阴茎癌的发生。据统计90％以上的阴茎癌是因包皮过长或包茎引起的。信奉伊斯兰教的男性7岁时割礼（割包皮），故阴茎癌的发病率极低。发达国家卫生条件和习惯好，发病率也很低。相反，在不发达国家则发病率高；如越南、印度等。我国解放前和解放初期发病率也高，由于目前生活水平提高，养成良好的卫生习惯后，阴茎癌发病率就直线下降。但在边远及落后农村仍多见，值得人们注意。由此可见，包皮环切及保持局部清洁是预防阴茎癌发生的重要手段。有包皮过长的少年儿童应经常上翻清洗阴茎头，以保持局部清洁，避免发生炎症。包皮口过紧不能上翻者应及早切除过长的包友。这不仅可预防阴茎癌的发生，而且避免了造成尿道狭窄的可能。因包茎造成的炎症可涉及到尿道口导致尿道口狭窄，出现排尿困难。长期狭窄会向尿道后方蔓延而造成整个前尿道狭窄，严重者最后可影响到肾脏，造成双肾积水。
然而，有些人顾虑做过包皮环切后会对性的敏感性有影响。
男性的性感区是阴茎头冠状沟及其正下方的阴茎系带和阴茎体部。刺激这些部位可引起性兴奋。有人对做过环切手术的人进行专门研究，指出手术前后阴茎的触觉没有改变。相反，有些人由于龟头与阴茎系带可暴露在外面，性的敏感性较前增强。
当包皮过长且包皮口较紧时，强行上翻后未能及时复位，过紧的包皮口就像狭窄的环紧紧地套在阴茎头处，此称为包皮嵌顿。在嵌顿以下部位血循环和淋巴回流受阻，阴茎与包皮水肿，更难以复位。长期嵌顿造成局部缺血加重，阴茎头会出现糜烂与坏死。因此，在包皮口较紧时应逐渐上翻，将包皮口撑大。包皮上翻后，及时翻回复位，复位困难时先在包皮内外涂上眼药膏，起润滑与消炎作用，再用双手轻压阴茎头，将包皮翻回，血循环恢复后，水肿自然消失。手法复位无效时，应由医生在阴茎背侧，纵行将包皮形成的狭窄环切开松解后，将包皮翻回复位。水肿及炎症消退后，行包皮环切术。凡有自己不能处理的问题或不清楚的问题，最好请教泌尿科医生，让他们来处理更妥当。
