淋球菌侵害的主要部位是男女的泌尿生殖系统，因为它对泌尿生殖道有特殊的亲和力。淋球菌最喜欢的地方是患者的尿道，它在这里生活、繁殖、破坏。一般感染淋球菌后可使尿道粘膜发炎36小时后，粘膜不但可有严重的红肿，而且可有脓液出现。